内蒙古杭锦荒漠生态系统定位观测研究站（以下简称杭锦生态站）批准时间为2015年5月，隶属于国家林业和草原局，由内蒙古自治区林业和草原局主管，建设单位内蒙古杭锦旗自然保护区管理局，技术依托单位为内蒙古农业大学。杭锦生态站是中国陆地生态系统定位研究网络的荒漠分中心---中国荒漠生态系统定位研究网络的成员站之一。位于内蒙古自治区鄂尔多斯市杭锦旗自然保护区管理局境内，地处库布齐沙漠西段，地理坐标N 39°22′22″～40º52′47″，E109°16′08″～116°55′16″，海拔为1000～1619m。

杭锦荒漠站覆盖区属于温带干旱、半干旱区分界线，荒漠草原与典型草原交错带，地理生境类型复杂，从黄河阶地盐渍化土地—流动沙丘—半固定沙地—盐尘暴源地—荒漠草原，是我国北方典型农牧交错带一个典型而又特殊的生态脆弱区，同时也是黄河泥沙重要输入源，京津风沙源治理工程、黄河中上游天然林保护工程、三北防护林工程、退耕还林工程核心区，直接影响着内蒙古沿黄经济带的生态安全。

杭锦站实行“一站五场，同步联测，多点辅助”的总体布局，主站建设在杭锦旗锡尼镇内，五个综合观测场分别代表荒漠草原、盐碱尘暴、半固定沙丘、流动沙丘及盐渍化土地景观类型。荒漠生态系统生态用水与水资源、植被承载力研究、土地利用与生物变化对生态系统结构与功能影响、荒漠生态系统碳收支动态研究、黄河沿岸土地盐渍化动态变化规律、人工固沙植被稳定性6方面的相关系统研究，可为黄河“几字湾”生态建设、“三北”防护林工程等北方防沙带生态保护和修复提供相关监测数据，助力山水林田湖草沙一体化保护和修复，切实服务于祖国北方生态安全屏障建设。